Aneuploidia je chromozomálna anomália, vyznačujúca sa kolísaním normálneho počtu chromozómov prítomných v bunke daného druhu.
Čo sa týka človeka, subjekt, ktorý má viac alebo menej chromozómov ako normálne číslo, ktoré je 46, sa považuje za aneuploid .
Aneuploidia môže ovplyvniť autozomálne chromozómy alebo pohlavné chromozómy a niekedy môže spôsobiť vážne následky. Jedným z najznámejších aneuploidií je Downov syndróm (alebo trizómia 21 ), ktorý sa vyznačuje prítomnosťou ďalšieho autozomálneho chromozómu 21 okrem dvoch kanónov.