Mojito je typický nápoj z Havany, hoci presné miesto, kde sa narodil tento nápoj, je stále predmetom diskusie.
Podľa zistení sa zdá, že na Kube v 16. storočí vznikol po príchode Francisa Drakeho nápoj s názvom "El Draque". V roku 1586, po námornom vpáde osadníkov do Cartageny de Indias, zamierili do Havany. Bohužiaľ, rôzne choroby začali decimovať posádku (najmä skorbut), takže malá skupina námorníkov pristála na Kubu, aby prevzala populárne lieky typické pre domorodcov. Vrátili sa s „aguardiente de cana“ (druh rumu), limetkou, mätou a šťavou z cukrovej trstiny. Vápno by samo o sebe stačilo na vyliečenie skorbutu, ale nikto si nedokázal predstaviť, že to bolo (ako v prípade mätovej a trstinovej šťavy) prísady určené na korekciu nepríjemnej chuti "zázračného alkoholického nápoja" ": El Draque."
Skutočný Mojito bol namiesto toho pokrstený (pravdepodobne) kubánskou populáciou (o niekoľko desaťročí neskôr) na základe podstatného mena „Mojo“, typického korenia na báze vápna. Ďalšia teória je, že pochádza z "mojadito", čo znamená "trochu mokré", alebo jednoducho z "mojado", alebo "mokré".
