Žltej zimnici možno predísť očkovaním, ktoré poskytuje dlhodobú imunitu (viac ako 10 rokov), účinnú u 90-95% príjemcov.
Vakcína, v súčasnosti schválená Svetovou zdravotníckou organizáciou, pozostáva zo živého a atenuovaného vírusu žltej zimnice 17D, ktorý sa pestuje na kuracích embryách. Vakcína sa podáva formou jednorazovej injekcie do ramena, ktorá sa má každých 10 rokov obnoviť. Ochranné protilátky sa objavujú 7-10 dní po inokulácii.
Očkovanie okrem toho, že je povinné pre niektoré destinácie, sa však odporúča pre cestujúcich, ktorí cestujú do endemických oblastí Afriky a Ameriky. Na druhej strane vakcína proti žltej zimnici je kontraindikovaná u detí pred 4 mesiacmi au tehotných žien; špeciálna opatrnosť sa odporúča aj u ľudí alergických na kuracie alebo vaječné proteíny, u imunokompromitovaných jedincov v dôsledku ochorení alebo terapií, u detí mladších ako 9 mesiacov au starších osôb.
