Pravdepodobnosť prenosu toxoplazmózy na plod sa líši podľa gestačného obdobia, v ktorom matka nakazila infekciu: riziko je na začiatku tehotenstva nízke a zvyšuje sa s postupom času. Naopak, závažnosť poškodenia hláseného dieťaťom je väčšia, akonáhle dôjde k prenosu matky a plodu. V prípadoch infekcie, ktorá sa znížila v šiestom mesiaci tehotenstva, môže spontánny potrat, predčasný pôrod alebo pôrod plodu predstavovať chorioretinitídu, hydrocefalus (alebo mikrocefáliu) a intrakraniálne kalcifikácie. Tieto neurologické príznaky môžu byť spojené s kožnými erupciami, atrofiou zrakového nervu, nystagmom, žltačkou, myokarditídou a pneumóniou.
V prípade pravdepodobnej a zistenej materskej toxoplazmózy z testu Toxo, aby sme vedeli, či Toxoplasma gondii skutočne prešla placentárnou bariérou a infikovala dieťa, je indikovaná amniocentéza (nie pred 15. týždňom tehotenstva). Vzorka plodovej vody odobratej počas vyšetrovania a podrobená PCR (polymerázová reťazová reakcia) umožňuje potvrdiť možnú prítomnosť DNA parazita, čím sa diagnostikuje fetálna infekcia. Na druhej strane môže echografické monitorovanie vykazovať jasné známky poškodenia plodu (intrakraniálne kalcifikácie, hydrocefalus, hepatomegália, retardácia intrauterinného rastu). Po narodení je podozrenie na vrodenú toxoplazmózu potvrdené v podstate sérologickými vyšetreniami a prítomnosťou príznakov ochorenia, ktoré sa môžu objaviť až o niekoľko rokov neskôr, najmä v neprítomnosti liečby.
