Inaktivovaná vakcína zahŕňa použitie kompletných vírusových alebo bakteriálnych častíc, ale chemicky spracovaných (napríklad s formalínom alebo chelatačnými činidlami, ako je etylénoxid) alebo fyzikálne (s ožiarením alebo teplom), takže stratia akúkoľvek kapacitu na replikáciu. alebo spôsobiť chorobu.
V porovnaní s oslabenými vakcínami majú hlavné výhody, stabilitu a bezpečnosť, ale zvyčajne indukujú nižšiu imunitnú reakciu a na zaistenie imunizácie sa má podať viac dávok vakcíny.
Tento typ imunizácie zahŕňa vakcíny Salk proti besnote a proti polypom.