U zvierat sa symptomatológia vtáčej chrípky líši tak vo vzťahu k vírusovému kmeňu, ktorý sa podieľa na infekcii, ako aj voči postihnutým druhom. Najmä u vtákov má infekcia benígny priebeh, ak je spôsobená nízkopatogénnymi vírusmi, ktoré patria do všetkých podtypov H ( LPAI - Low Pathogenic Avian Influence ). Choroba spôsobená vírusom LPAI je lokalizovaná a charakterizovaná respiračnými a enterickými symptómami, často spojenými so všeobecnou malátnosťou, slzami a reprodukčnými abnormalitami u hospodárskych zvierat (napr. Zmeny vajec a zníženie znášky vajec).
Na rozdiel od toho niektoré vírusové kmene patriace podtypom H5 a H7 môžu spôsobiť vysoko patogénnu vtáčiu chrípku ( HPAI - High Pathogenic Avian Influence ), čo je vždy systémové a závažné ochorenie spojené s vysokou mortalitou medzi niektorými druhmi voľne žijúcich a domácich vtákov. Najviditeľnejšie príznaky sú v nervovom systéme, s depresiou zmyslovej, spätnej rotácie hlavy a paralýzou krídel.
