Užívanie antikoncepcie môže ovplyvniť hladinu cholesterolu v krvi. Hmotnosť tohto účinku závisí od typu použitej antikoncepcie, presnejšie od koncentrácie estrogénov a progestínov. Zdá sa, že estrogény obsiahnuté v antikoncepčných tabletách v skutočnosti mierne zvyšujú hladinu dobrého cholesterolu (HDL), pričom zároveň znižujú hladinu dobrého cholesterolu (LDL); konečný výsledok je mierne zvýšenie celkového cholesterolu, sprevádzané významným zvýšením triglyceridov. Progestogény obsiahnuté v antikoncepčných tabletkách by namiesto toho mali opačný účinok, vzhľadom na tendenciu zvyšovať LDL cholesterol znižujúci kvótu HDL.