Takzvaná hnilobná črevná flóra má schopnosť stráviť proteíny a malé peptidy, ktoré unikli tráveniu a enterálnej absorpcii.
Putrefaction, nie je prekvapením, je proces rozkladu proteínov. Nie je to ani skutočnosť, že diéta s vysokým obsahom bielkovín podporuje vývoj prevažne hnilobnej črevnej flóry.
Problémy vyplývajú zo skutočnosti, že tieto baktérie vychádzajú z proteínov a produkujú rôzne látky (amíny, amoniak, fenoly, indoly); medzi nimi niektoré (najmä amíny) dávajú nadúvanie nepríjemný zápach (napr. putrescine a kadaverín), zatiaľ čo iné sú obzvlášť toxické, ak nie sú karcinogénne.
Len si predstavte nitrosačné reakcie, z ktorých môžu byť generované karcinogénne kompozity, ako sú nitrózoamíny. To by vysvetľovalo, prečo je strava bohatá na mäso a málo ovocia a zeleniny spojená so zvýšeným rizikom kolorektálneho karcinómu.
