Vírus Marburg sa pomenoval podľa nemeckého mena rovnakého mena, kde sa prvýkrát objavil v roku 1967, keď spôsobil tri súčasné vypuknutia v Nemecku (mestá Marburg a Frankfurt) a v bývalej Juhoslávii (Belehrad). V oboch krajinách bol vírus Marburg pravdepodobne zavedený dovozom ugandských zelených opíc ( Cercopithecus aethiops, tiež známych ako šedo-zelené Cercopiteco).
Prvé prípady boli zaznamenané medzi pracovníkmi laboratória v tesnom kontakte s týmito primátmi. Sekundárne prípady zahŕňali zdravotnícky personál v nemocniciach vystavených infikovanému biologickému materiálu.
Následne boli v Južnej Afrike, Keni, Demokratickej republike Kongo a Angole zaznamenané sporadické epizódy alebo epidémie, a to celkovo približne 600 prípadov a 480 úmrtí.
