Zdá sa, že príjem vitamínu B12 v niektorých prípadoch viedol k vývoju určitých hematologických nežiaducich reakcií. Konkrétne sa spomína tendencia k tvorbe periférnej vaskulárnej trombózy. Farmakologická liečba deficitu B12 môže preto odhaliť „polycytémiu vera“, ktorá sa vyznačuje objemovým zvýšením krvi a počtom červených krviniek.
Súčasne korekcia dobre známej megaloblastickej anémie prostredníctvom integrácie vit. B12 môže indukovať zníženie plazmatického draslíka až do fatálnej hypokalémie.
Okrem toho sa u predisponovaných subjektov pozorovalo aj zvýšenie výskytu dny.
Ako je dobre známe, masívny doplnok B12 je tiež schopný čiastočne zakryť nedostatok kyseliny listovej.