V súčasnosti neexistuje vhodná vakcína, ktorá by zabránila Marburgovej horúčke . Z tohto dôvodu je dôležité prijať správanie zamerané na zabránenie nákazy.
Najmä cestujúci, ktorí cestujú do krajiny, kde prebieha epidémia Marburg, musia prísne dodržiavať hygienické postupy, napríklad umývanie rúk a vyhýbanie sa dotýkaniu sa predmetov, ktoré prišli do kontaktu s chorými alebo mŕtvymi ľuďmi; v prípade náhleho nástupu horúčky je nevyhnutné okamžite kontaktovať lekára. Okrem toho Svetová zdravotnícka organizácia odporúča, aby nejedli mäso z voľne žijúcich zvierat, ako sú šimpanzy alebo opice.
Aby sa zabránilo prenosu, všetky podozrivé prípady si vyžadujú prísnu izoláciu vo vybavených zariadeniach a prijatie osobitných postupov manipulácie, okrem používania ochranných zariadení (masky, štíty na tvár, plášte a rukavice).
